Inférer l’histoire évolutive du vivant à partir de phylogénies. (A, haut) À mesure que le clade évolue, les espèces divergent (points), s’éteignent (étoiles), ou survivent. (A, en bas) La phylogénie reconstruite à partir des espèces actuelles représente une histoire partielle des événements de spéciation dans ce clade. (B) La modélisation permet, à partir d’une phylogénie, de déduire des éléments de l’histoire évolutive d’un clade, comme la variation au cours du temps du nombre d’espèces, du taux de spéciation et du taux d’extinction ont varié au cours du temps. (C) Le profil de densité spectrale résume de manière exhaustive la forme d’une phylogénie. Les profils pour différentes espèces de clades peuvent être directement comparés et chaque profil peut être caractérisé par le logarithme (ln) de sa valeur propre principale (λ*), son asymétrie (ψ), et sa hauteur de pic (η).