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Tableau I.

Stratégies pour diminuer l’oncogénicité des γRV. La stratégie courante pour diminuer le risque de dérégulation de gènes cellulaires par des γRV (γ-rétrovecteur) intégratifs consiste à éliminer les éléments cis-régulateurs de la transcription (enhancer et promoteur) des LTR (long terminal repeat ; γRV SIN, self-inactivating). Cette stratégie (« neutralisation ») nécessite d’ajouter au γRV un promoteur interne. Elle diminue nettement l’oncogénicité des γRV, surtout si le promoteur interne est faible [5, 6, 10] ; elle réduit en outre les risques d’apparition de dérivés réplicatifs et peut permettre d’obtenir une expression du/des transgène(s) spécifique(s) d’un tissu [6]. Le rôle clé des protéines BET (bromodomain and extraterminal) dans le ciblage de l’intégration suggère d’autres pistes. La première est d’empêcher le γRV d’utiliser les protéines BET (« désorientation »), ce qui rend l’intégration plus aléatoire. Cette désorientation est obtenue de deux façons [2, 11, 16] : (1) déplétion (knock-down) ou inhibition (pharmacologique) transitoires des protéines BET au moment de l’infection. De nombreux inhibiteurs (JQ1, I-BET 151, etc.) fixent les bromodomaines des protéines BET et bloquent ainsi leur interaction avec les lysines acétylées ; (2) invalidation du peptide EBM (ET[extraterminal]-binding motif) de IN (intégrase) (Figure 2A) (γRV BIN, BET-independent). Différentes versions de γRV BIN existent : celle portant une IN mutée sur le résidu tryptophane (W) conservé (astérisque sur la Figure 2A) garde un titre et une capacité intégrative quasi-normaux alors que celle portant une IN complètement amputée de EBM est plus affectée. Enfin, une autre stratégie consiste à « réorienter » l’intégration des γRV par l’expression d’un domaine ET fusionné à un domaine d’adressage « épigénomique » hétérologue (différent de leurs bromodomaines). LEDGF(lens epithelium derived growth factor)/p75 joue un rôle clé pour le ciblage de l’intégration des lentivirus (et des lentivecteurs LV) dans le corps des gènes transcrits. LEDGF/p75 peut être divisée en deux parties : le domaine N-terminal (résidus 1-324) reconnaît des marques épigénétiques spécifiques du corps des gènes transcrits, la partie C-terminale reconnaît IN des lentivirus [2]. L’expression d’une chimère fusionnant le domaine ET de BRD4 (bromodomain-containing protein 4) au domaine 1-324 de LEDGF conduit le γRV à adopter un profil d’intégration lentiviral, biaisé en faveur du corps des gènes transcrits et moins concentré dans les promoteurs [12]. Pour d’autres stratégies, voir [6, 16]. *La chimère LEDGF-ET contient, en plus du domaine ET, un court domaine de BRD4 (domaine SEED, Ser-Glu-Glu-Asp) adjacent au domaine ET [12].

Buts Moyens Résultats
Neutralisation Minimiser l’activation transcriptionnelle de gènes de l’hôte suite à l’intégration γRV SIN : élimination des séquences cis-régulatrices de la transcription dans les LTR Oncogénicité réduite [5, 6, 10]

Désorientation Réduire la fréquence des intégrations dans les enhancers et les promoteurs des gènes de l’hôte
  • inhibition transitoire (pharmacologique ou knock-down) des protéines BET

  • γRV BIN : inactivation du peptide EBM de IN (délétion ou mutation ponctuelle)

Intégration plus aléatoire [2, 11, 16]

Réorientation Rediriger l’intégration des γRV Expression dans les cellules d’une protéine artificielle fusionnant un domaine ET et un domaine responsable d’un adressage « épigénomique » choisi Intégration dans le corps des gènes transcrits avec une chimère entre le domaine ET* de BRD4 et le domaine de liaison à la chromatine de LEDGF/p75 [12]

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