Variants candidats potentiellement causatifs au niveau d’un QTL. Un QTL pour la masse cardiaque sur le chromosome 1 (A) et un QTL pour le poids du corps sur le chromosome 3 (B) Sont présentés. La position sur le chromosome est indiquée sur l’axe horizontal et la significativité de l’association entre variation génétique et variation phénotypique, exprimée en -log₁₀P, sur l’axe vertical. La ligne noire indique l’association avec les haplotypes, alors que chaque point bleu indique l’association avec un variant de séquence. Les points bleu foncé correspondent à des variants candidats, c’est-à-dire dont l’association avec le phénotype est au moins aussi significative que l’association la plus significative entre haplotypes et phénotype au QTL. Le panneau A est donc un exemple de QTL avec variants candidats, tous situés dans le gène Shank2, alors qu’aucun variant candidat n’existe au QTL présenté dans le panneau B.