Principaux mécanismes d’action des ARN régulateurs bactériens. Les ARN cis-régulateurs correspondent à des régions non traduites d’ARNm qui adoptent différentes conformations en fonction des conditions physiologiques. Les différents repliements influencent l’expression de/des séquence(s) codante(s) située(s) en aval. Dans le cas présenté en (A), la présence d’une molécule effectrice (ligand) permet la formation d’un terminateur de transcription qui prévient la synthèse du transcrit complet. Les ARNm et ARN cis-régulateurs sont représentés en bleu. Les ARN trans-régulateurs agissent sur des ARNm ou des protéines. Lorsqu’ils ciblent les ARNm (B), leur appariement peut masquer le site d’initiation de la traduction et bloquer la synthèse protéique favorisant généralement une dégradation du messager. Les ARN trans-régulateurs sont représentés en rouge. La séquence AUG correspond au codon d’initiation de la traduction et SD indique la séquence Shine-Dalgarno d’interaction avec l’ARN ribosomique 16S. Alternativement (C), la présence d’un ARNrég peut stimuler la traduction d’une protéine en démasquant un site d’initiation de la traduction. La formation de complexes ARNrég/ARNm cible peut prévenir (D) ou stimuler (E) une activité ribonucléases (RNase). Certains ARNrég piègent des protéines régulatrices (F) et d’autres miment la structure d’un type de complexe d’initiation de transcription (G) afin de neutraliser l’ARN polymérase associée à un facteur sigma donné (σ⁷⁰) pour réorienter la transcription de gènes médiée par un facteur σ alternatif. Les ribosomes et les RNases sont grisés, les protéines régulatrices sont jaunes, l’ARN polymérase est bleu ciel et son facteur σ⁷⁰ est violet. L’ADN est représenté en noir.