Réactivation du chromosome X inactif et pluripotence. Dès la transition 2-4 cellules dans l’embryon préimplantatoire, le chromosome X paternel est inactivé par défaut. Cette première vague d’inactivation (flèche rouge) est maintenue dans la morula et dans les lignages extraembryonnaires (trophectoderme, en rose ; endoderme primitif en violet). En revanche, lorsque les cellules de la masse cellulaire interne (MCI) du blastocyste acquièrent la pluripotence, alors l’Xp inactif est spécifiquement réactivé (flèche verte). Par la suite, les cellules de la MCI se différencient pour former les tissus de l’embryon à proprement parler, et l’inactivation aléatoire se met en place (flèche rouge). Le chromosome X inactif aléatoirement choisi ne sera réactivé (flèche verte) que dans la lignée germinale (LG). Dans l’embryon, l’X inactif est donc réactivé uniquement dans les compartiments pluripotents. In vitro, la différenciation des cellules ES est accompagnée par l’inactivation aléatoire, mise en place après le recouvrement d’un seul X par l’ARN Xist (visualisé ici par la technique d’ARN FISH ; en vert, Xist, en rouge un gène du chromosome X qui s’exprime, dans les cellules différenciées, exclusivement à partir de l’X non recouvert par Xist). Le mécanisme inverse peut être observé lorsqu’une cellule somatique est reprogrammée en cellule pluripotente. Dans les cellules pluripotentes, l’absence d’inactivation est due, au moins en partie, à l’absence d’expression de Xist.