Schéma du processus autophagique. En réponse à différents stimulus (carence en nutriments, hypoxie, modification de la balance énergétique AMP/ATP, présence de micro-organismes, production d’espèces oxygénées réactives, ADN endommagé), les complexes protéiques mTor et Beclin1 induisent la formation d’une structure membranaire pré-autophagique (A). Les 2 systèmes de conjugaison Atg16L1/Atg5/Atg12 et LC3 permettent la formation du phagophore par élongation de la membrane et séquestration d’éléments cytoplasmiques (protéines, organites ou bactéries) (B). La fermeture de la double membrane conduit à un autophagosome (C) qui fusionne avec des lysosomes (D) et conduit à la dégradation de la membrane interne et du contenu intra-vacuolaire (E).