La structure de l’ARNm module l’efficacité de la traduction. La plupart des ARNm bactériens possèdent des motifs structuraux (A) qui sont sensibles à de nombreux facteurs environnementaux comme la température, ou qui interagissent spécifiquement avec un facteur agissant en trans (B) et qui répondent à un signal donné (métabolites, ARN non codant, protéine). Un changement de structure de l’ARNm peut conduire soit à une activation de la traduction (en rendant accessible le site de fixation du ribosome), soit à une inhibition (en masquant les signaux de reconnaissance par le ribosome dans la région d’initiation de l’ARNm qui contient fréquemment la séquence Shine et Dalgarno spécifique des bactéries). C. L’initiation de la traduction implique plusieurs étapes successives dont la formation d’un complexe de pré-initiation où l’interaction ARNm-ARNt initiateur n’a pas encore eu lieu (en encadré). La plupart des régulateurs agissent à cette étape, soit en empêchant le ribosome d’accéder à son site (compétition), soit en le piégeant dans un complexe de pré-initiation inactif (piège). S’il y a adaptation de l’ARNm, le complexe d’initiation 30S peut se former, pour ensuite s’assembler avec la sous-unité ribosomique 50S et former le complexe d’initiation 70S du ribosome prêt à commencer la synthèse des protéines.