Schéma positionnant les principales protéines sur le pré-ARNm, ainsi que les séquences en cis les plus déterminantes pour la réaction d’épissage. La fonction des protéines SR (serine-rich) (représentées en orange) peut être réglée au niveau transcriptionnel, en fonction du tissu ou du stade de développement, par épissage alternatif, par phosphorylation-déphosphorylation, ce qui influence leur localisation subcellulaire et leur activité [45]. Elles sont stockées dans des compartiments du noyau appelés speckles ou SFC (splicing factors compartments) [46]. Elles doivent être recrutées par le complexe d’épissage et dirigées à la périphérie des SFC vers les sites de transcription. Une fois engagées dans le splicéosome, elles sont les cibles de phosphatases Ser/Thr, PP1, PP2A, PP2Cγ, dont certaines font partie intégrante du splicéosome [47]. Les protéines hnRNP (heterogeneous nuclear ribonucleoproteins) (représentées en jaune) figurent parmi les protéines les plus abondantes du noyau ; certaines d’entre elles sont confinées dans le nucléoplasme (hnRNP C et U), tandis que d’autres (hnRNP A, B, K, J) font la navette entre le noyau et le cytoplasme [48]. L’ESE (exonic splicing enhancer) (représenté en violet au niveau de l’exon) est le siège de nombreuses mutations qui modifient le site de liaison de protéines SR et conduisent à l’exclusion d’exon. Dans le cas de la myopathie de Becker, la mutation non-sens Glu1211X, touchant un ESE, conduit à une manifestation morbide modérée, tandis que la plupart des autres mutations non-sens entraînent la production de protéines tronquées, à l’origine d’un phénotype très sévère. Un algorithme de prédiction d’ESE fonctionnels est disponible en ligne (http://exon.cshl.edu/ESE/index.html). L’ESS (exonic splicing silencer) (représenté en vert au niveau de l’exon) agit, entres autres, par liaison à hnRNP I (ou PTB) et hnRNP A/B ou H. HnRNP A1 peut également induire la répression par liaison à un site exonique et par le recrutement coopératif d’autres hnRNP, ce qui neutralise l’activité d’enhancers proximaux, voire l’assemblage du splicéosome. L’ISE (intronic splicing enhancer) et l’ISS (intronic splicing silencer) (représentés respectivement en violet ou en vert au niveau de l’intron) auraient des rôles antagonistes, lesquels peuvent s’exercer au sein d’éléments introniques bipartites.