Arbre phylogénétique des lignées de SIV (simian immunodeficiency virus). Cet arbre a été construit à partir des séquences protéiques Pol de lentivirus de primates représentatifs des six lignées principales : SIVcpz, retrouvée chez les chimpanzés (Pan troglodytes) et associée au VIH-1 ; SIVsm, identifiée chez le mangabey enfumé (Cercocebus atys) et associée au VIH-2 ; SIVagm, présente dans les quatre espèces de singes verts (membres du genre Chlorocebus) ; SIVlhoest, du singe de l’Hoesti (Cercopithecus lhoesti), associée au SIVsun du cercopithèque à queue de soleil (Cercopithecus solatus) et au SIVmnd-1 des mandrills (Mandrillus sphinx) ; SIV-syk, du cercopithèque à diadème (Cercopithecus albogularis) ; SIVcol, décrite chez le colobe guéréza (Colobus guereza). Cet arbre a été obtenu par la méthode neighbor joining, et sa robustesse évaluée par un test de bootstrap (100 répliques). La longueur des branches est proportionnelle à la distance évolutive entre les différentes souches virales.