Représentation schématique de la cubiline et de la mégaline. La structure tridimensionnelle d’un domaine CUB (complément C1r/C1s, Uegf [epidermal growth factor sea urchin related protein] et bone morphogenic protein-1), caractérisée par deux couches de 5 feuillets β antiparallèles reliés par des coudes β, a été déterminée en prenant comme matrice la structure des spermadhésines. La mégaline est caractérisée par trente-six motifs de classe A ou ligand binding repeats, flanqués de motifs EGF (epidermal growth factor) et répartis en quatre blocs. Le domaine cytoplasmique comporte deux signaux d’internalisation par les puits à clathrine du type NPXY (Asn-Pro-X-Tyr).