Représentation schématique de la structure générale de la grande sous-unité des calpaïnes (calpaïne 1 ou 2), de la petite sous-unité des calpaïnes (calpaïne 4) et de la calpastatine. La grande sous-unité des calpaïnes est divisée en cinq domaines caractéristiques. I: domaine N-terminal; II: domaine catalytique divisé en deux parties par le sillon du site actif; III: domaine régulateur; IV: domaine associé au domaine III par une région linker (orange) et caractérisé par la présence de quatre motifs EF-hand (jaune) qui confèrent à la molécule sa sensibilité au Ca²⁺. Le domaine IV assure la liaison de la grande sous-unité à la petite sous-unité. Celle-ci a deux domaines en plus du domaine N-terminal. V: domaine hydrophobe riche en résidus glycine; VI: domaine homologue au domaine IV des calpaïnes 1/2. La molécule de calpastatine est divisée en cinq domaines. I: domaine N-terminal; II à V: domaines répétitifs responsables de l’activité inhibitrice vis-à-vis des calpaïnes.