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Figure 2.

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Atlas du cerveau de souris défini sur les plans spatial et moléculaire. Après dissection de régions du cerveau, les cellules ont été isolées et les ARN séquencés. Environ 7 000 000 cellules ont été traitées et 8 000 gènes analysés pour effectuer des regroupements en 34 classes, 338 sous-classes, 1 201 super-types et 5 322 clusters. A. Traitement mathématique des données (uniform manifold approximation and projection, UMAP) qui présente une image plane de la parenté génétique de différentes sous-classes identifiées dans l’UMAP par une couleur. B. L’emplacement exact des cellules a été déterminé sur des coupes à l’aide d’anticorps ciblant 1 100 gènes, par une version sophistiquée de la technique FISH permettant d’utiliser de multiples antigènes (MERFISH). La partie inférieure de la Figure montre les différentes coupes du cerveau, coronales et sagittales, colorées d’après les sous-classes de cellules qu’elles contiennent. Figure adaptée d’après [16].

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